产品名称 | 货号 | 规格 | 说明 |
彗星法DNA损伤分析试剂盒(最常用) | D-AKE3040-15T | 15T(3孔载玻片) |
*为方便客户使用试剂盒,艾美捷科技善意将其翻译成中文操作手册,请以试剂盒中配套的英文版为准。因编者翻译水平有限,对于由本说明书中不当翻译所造成的损失,概不负责,如有错误,欢迎指正!
实验开始前,建议先通读说明书(请以试剂盒中配套的英文版为准):
介绍:由于环境因素和细胞内正常的新陈代谢过程,DNA损伤每天以每个细胞1000到100万个分子损伤的速度发生。虽然这只占人类基因组约60亿个碱基(30亿个碱基对)的一小部分,但关键基因的未修复损伤可能会阻碍细胞发挥其功能的能力,并显著增加癌症的可能性。彗星实验(Comet assay)也被称为单细胞凝胶电泳实验(Single cell gel electrophoresis,SCGE),是一种超灵敏的单细胞水平上检测DNA损伤的技术。在电泳场下,损伤的细胞DNA(包含碎片和链断裂)从完整的DNA中分离出来,在显微镜下形成典型的“彗星尾巴”形状。DNA损伤的程度通常是通过测量彗星尾巴来目测的,也可以使用图像分析软件来测量各种参数。
OxiSelect™ Comet Assay是一种快速、灵敏的,用于测量细胞DNA损伤的试剂盒。每个试剂盒提供足够的试剂,最多可进行15次检测。
OxiSelect™ Comet Assay实验原理:Cell Biolabs 的 OxiSelect™ Comet Assay 是一种单细胞凝胶电泳法 (SCGE),用于简单评估细胞 DNA 损伤。首先,将单个细胞与低熔点琼脂混合后,再应用到OxiSelect™ Comet特制玻片上。然后,用裂解缓冲液和碱性溶液处理这些嵌入的细胞,使DNA松弛并变性。最后,在电泳槽中对进行电泳,以分离完整的DNA和受损的片段。电泳后,样品被干燥,用DNA染料染色,并通过外显荧光显微镜可视化。在这些条件下,受损的DNA(包含裂解和链断裂)将比完整的DNA迁移更多,并产生 "彗星尾 "形状(见图1)。
图1,彗星实验原理与流程示意图
产品名称 | 产品货号 | 规格 |
彗星法DNA损伤分析试剂盒 | D-AKE3040-15T | (3孔载玻片) |
客户自备材料:
1.氯化钠粉末
2.NaOH颗粒
3.10 N NaOH,用于调整pH值 (10 N NaOH = 10 M NaOH =10 mol/L NaOH)
4.DMSO(可选)
5.70%乙醇
6.TE缓冲液(10mM Tris,pH 7.5,1mM EDTA)。
7.PBS(不含Mg2+和Ca2+)。
8.EDTA(二钠盐)
9.DI H2O(去离子水)
10.37ºC和沸水浴
11.水平电泳槽
12.可调节的单通道微量移液器,带一次性吸头。
13.带FITC过滤器的外显荧光显微镜
保存条件:收到试剂盒后,将绿色荧光DNA染料,10000X存放在-20ºC。 所有其他试剂盒组件在室温下储存。
一、试剂准备:
1.OxiSelect™ CometAgarose:将Comet Agarose瓶放在90-95ºC水浴中加热20分钟,或者直到琼脂胶液化。将瓶子转移到37℃的水浴中20分钟,并保持直到使用。
2.1X Vista Green DNA Dye工作液:使用TE缓冲液(10 mM Tris, pH 7.5, 1 mM EDTA)稀释原10000X的Vista Green DNA Dye母液,按照1:10000的比例,稀释成1X的Vista Green DNA Dye工作液。1X工作液可在4℃避光条件下保存3周。
3.Lysis Buffer: 准备100ml的1X 裂解缓冲液
NaCl | 14.6 g |
EDTA Solution (试剂盒提供) | 20ml |
10X Lysis Solution (试剂盒提供) | 10ml |
DMSO | 10ml(样品中含血红素,则加入) |
DI H2O(去离子水) | 调整体积到90ml |
充分混合以溶解NaCl。缓慢加入10 M的NaOH来调节Lysis Buffer的pH值到10.0,最后再使用去离子水调整体积,定容到100ml。冷藏裂解液到4℃,直到使用。 | |
* Note: 缓冲液在室温下会看起来浑浊,但在4ºC时会变清。pH也会保持在约10.0。 |
* 血红素在4℃成胶状,用DMSO溶解的血红素。DMSO的添加是任选的,仅对含有血红素的样品(例如血细胞或组织样品)是必需的。加入DMSO对实验结果没有影响。
4.Alkaline Solution:准备100ml的碱性溶液
NaOH | 1.2g |
EDTA Solution (试剂盒提供) | 0.2ml |
DI H2O(去离子水) | 调整体积到100ml |
充分混合以溶解NaOH。冷藏碱性溶液到4℃,直到使用。 |
5.Electrophoresis Running Solution: 准备1L电泳缓冲液,需求选择电泳模式(二选一):
电泳模式 | 检测类型 | 电泳时间 | 说明 |
TBE电泳(中性电泳) | 检测单链和双链DNA的断裂 | 推荐 10-15 mins | 分析细胞凋亡的首选方法,可使用尾巴长度而非尾矩进行数据分析。 |
碱性电泳 | 检测单链和双链DNA的断裂,AP位点损伤在内的所有DNA 损伤 | 推荐 15-30mins | 灵敏度最高! |
* 实验过程中的各类缓冲液都需要4℃预冷。
5.1 TBE Electrophoresis Solution (中性)
Tris Base | 10.8g |
Boric Acid | 5.5g |
EDTA(二钠盐) | 0.93g |
DI H2O(去离子水) | 调整体积到1L |
充分混合以溶解固体颗粒。冷藏TBE电泳缓冲液到4℃,直到使用。 |
或者5.2 Alkaline Electrophoresis Solution (300 mM NaOH, pH >13, 1 mM EDTA)(碱性)
NaOH | 12g |
EDTA Solution (试剂盒提供) | 2ml |
DI H2O(去离子水) | 调整体积到1L |
充分混合以溶解NaOH。冷藏碱性电泳缓冲液到4℃,直到使用。 |
特殊说明:为避免紫外线对细胞样品造成额外损害,请在弱光条件下进行实验。
二、准备样品和玻片:
1.准备裂解缓冲液、碱性溶液和电泳缓冲液(见试剂准备),然后再进行实验。将所有溶液彻底冷却至4ºC。
2.将OxiSelect™ Comet Agarose放在90-95ºC水浴中加热20分钟,或者直到琼脂胶液化。将瓶子转移到37℃的水浴中20分钟进行冷却,并保持直到使用。
3.在OxiSelect™ Comet玻片上,每孔加入75 ul 37℃的Comet Agarose,形成基层胶。用移液器将胶溶液涂抹在孔上,确保完全覆盖和平铺。将载玻片转移到4ºC下水平放置15分钟,使其固化。
4.按照如下方式准备细胞样品,与对照细胞:
悬浮细胞:以700×g离心2mins,弃上清,用冰冷的PBS(无Mg2+和Ca2+)洗涤细胞一次,离心,弃上清。最后,用预冷4℃的PBS(无Mg2 +和Ca 2 +)重悬细胞到1×105个细胞/ml 。
贴壁细胞:轻轻地从细胞培养瓶/培养皿中取出细胞,用橡胶细胞刮处理。将细胞悬浮液转移到锥形管(EP)中,并在700×g离心2mins,弃上清。用冰冷的PBS(不含Mg2+和Ca2+)洗涤细胞一次,离心,并丢弃上清液。最后,用预冷4℃的PBS(无Mg2 +和Ca 2 +)重悬细胞到1×105个细胞/ml 。
组织样品:使用解剖剪刀,切碎一小块组织到1-2ml冰冷的含20mM EDTA的PBS缓冲液(无Mg2 +和Ca 2 +)。组织/细胞悬浮液放置5分钟,然后将上清液转移到离心管中,避免转移碎片。700×g离心2mins,丢弃上清液。最后,用预冷4℃的PBS(无Mg2 +和Ca 2 +)重悬细胞到1×105个细胞/ml 。
* 推荐阳性对照:使用20 uM Etoposide(依托泊苷)处理4小时。
5.将细胞悬液与Comet Agarose(步骤2)以1:10的比例(v/v),用移液枪混合均匀,并立即转移75ul 到每个孔中的原基层胶上方(步骤3)。确保完全覆盖平铺孔板,非常轻柔和小心地用移液管尖传播的悬浮液,而不干扰基层胶。
Note: 对于多个样品的处理,将细胞与Comet Agarose混合液保持在37℃,避免凝胶化。准备好样品后,重新混匀,依次取出75ul加入到玻片孔中。
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