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快速高效MeDIP检测,看这款富集5mC DNA试剂盒

发布时间:2024-06-26 分享到:

DNA甲基化是表观遗传学中的基本机制,在不改变潜在DNA序列的情况下调节基因表达和染色质结构。表观遗传修饰如DNA甲基化可以影响各种生物学现象,包括发育,分化和疾病易感性。

DNA甲基化

DNA的甲基化是一个可逆的生物化学过程,其中甲基(CH 3)被添加到DNA分子,特别是DNA序列内的胞嘧啶(C)碱基。DNA甲基转移酶(DNMT)促进了这一过程,DNMT将CH 3从化合物S-腺苷-L-甲硫氨酸(SNMet)转移到胞嘧啶嘧啶环的第五个碳位置,从而形成5-甲基胞嘧啶(5 mC)(图1)。在真核细胞中,这主要发生在DNA序列中鸟嘌呤碱基之前的胞嘧啶碱基处,形成CpG二核苷酸。

Methylation of cytosine in DNA via DNA methyltransferase and S-adenosyl-L-methionine

图1.通过DNA甲基转移酶和S-腺苷-L-甲硫氨酸对DNA中胞嘧啶进行甲基化。

富集5mC DNA

DNA甲基化的失调与各种人类疾病有关,包括癌症、神经发育障碍和衰老相关疾病,这使得5mC修饰不仅在基础科学研究中引起兴趣,而且是医学目的的重要靶点。因此,5mC DNA的高度特异性捕获和富集应该为方便和全面地鉴定正常和患病细胞的甲基化状态提供优势,这可能导致新的诊断和治疗方法的开发。

已经使用了几种技术来富集甲基化DNA。例如,组氨酸标记的甲基-CpG结合结构域蛋白已被用于选择性地结合5 mC DNA,并通过镍包被的磁珠分离从基因组DNA(gDNA)库中分离甲基化DNA。然而,这些技术到目前为止是相当耗时的、劳动密集型的,并且具有低产量。甲基化DNA免疫沉淀(MeDIP)为5 mC DNA富集提供了一种更简单,更具成本效益的方法。MeDIP利用特异于5 mC的抗体选择性地免疫沉淀甲基化DNA。

MeDIP如何工作

在传统的MeDIP中,gDNA首先被剪切成较小的片段,通常通过超声处理或酶消化,以促进随后的免疫沉淀步骤(图2)。将片段化的DNA与抗5 mC抗体一起孵育,所述抗5 mC抗体选择性地结合DNA片段中的甲基化胞嘧啶残基。抗体-DNA复合物可以被抗体亲和珠如蛋白A/G磁珠或蛋白G琼脂糖珠捕获,允许通过磁性分离或离心分离它们。然后将DNA从抗体中释放并纯化,并且可以使用各种下游应用(如PCR、微阵列或NGS)分析富集的含5 mC的片段,以绘制整个基因组或特定基因座处的DNA甲基化模式。

MeDIP workflow

图2. MeDIP工作流程。

简单性、可靠性和一致性

一个典型的MeDIP协议可以在2天内完成。为了实现更快速、更高效的MeDIP检测,EpigenTek提供了一套全面的产品来满足您的研究需求,包括流行的Methylamp™甲基化DNA捕获试剂盒 P-1015-24,该试剂盒使用专有和独特的程序和试剂组合来富集5mC DNA。该套件具有以下特点和优点:

  • 非常有效地富集(98%)甲基化DNA。

  • 非常快速和方便的程序,可以在3小时内完成。

  • 条形微孔板形式使分析灵活,可用于手动或高通量处理。

  • 采用高度特异性的单克隆抗体进行5mC捕获。

  • 包括用于DNA纯化的旋转柱和收集管,节省时间并减少劳动力。

  • 使用预先优化的MeDIP条件实现高重现性。

  • 兼容所有基于DNA扩增的应用。


产品名称货号
规格
Methylamp™甲基化DNA捕获试剂盒P-1015-24用于富集和捕获甲基化DNA片段,用于微阵列、PCR或NGS应用