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替代RIP实验和CUT&RUN的选择-CUT&LUNCH RIP试剂盒

发布时间:2024-12-18 分享到:

在体内富集蛋白质复合物 RNA,然后进行 qPCR 和/或下一代测序,为研究表观转录组范围的蛋白质-RNA 相互作用提供了一种有利的工具。长期以来,实现这一目标的主要方法是传统的 RIP(RNA 免疫沉淀)后进行 PCR (RIP-PCR) 或测序 (RIP-Seq)。这些方法已得到广泛应用,但无法实现高分辨率,需要交联,并且重现性差,过程复杂。特别是,这些方法非常耗时(从 8 小时到 2 天不等)且成本高昂。

 

利用CUT&LUNCH RIP加快蛋白质/RNA相互作用研究速度

RNA免疫沉淀(RIP)被广泛用于分析蛋白质和RNA之间的相互作用,但难以实现高分辨率,容易出现重复性差和耗时复杂的问题。通过使用EpiNext™ CUT&LUNCH RNA免疫沉淀(RIP)试剂盒,您可以比以往更快地对目标蛋白质/RNA复合物进行高度特异性富集。

极速 3 步方案

EpiNext™CUT&LUNCH RIP试剂盒的示意图EpiNext™CUT&LUNCH RIP试剂盒 试验时间长度比较

 

产品名称货号规格

EpiNext CUT&LUNCH RNA 免疫沉淀 (RIP) 试剂盒

EpiNext CUT&LUNCH RNA Immunoprecipitation (RIP) Kit

P-2037-2424 Reactions

 

CUT&LUNCH(Cleavage Under Target and Liberate Unique Nucleic Complex Homogenously)是由EpigenTek最近开发的,为研究体内DNA-蛋白质相互作用提供了比ChIPCUT&RUN更快速、高效的替代方案。同样的创新技术现已融入新的CUT&LUNCH RIP试剂盒中,用于超快速、高度特异性地富集目标蛋白质-RNA复合物。

将当前RIP实验和CUT&RUN的所有优势整合在一起,CUT&LUNCH RIP是富集RNA结合蛋白特异性RNA复合物的最快、最便捷的方式。

  • 快速方案:在两小时内完成整个实验。

  • 低背景:非特异性蛋白质-RNA复合物被选择性消除。

  • 高特异性和分辨率:只有与抗体结合的复合物被回收。

  • 具有成本效益:每反应的价格不到竞争对手RIP产品的一半。

不要被冗长的实验步骤拖延。简化您的研究,选择CUT&LUNCH RIP,节省时间,没有拖累,只有成功之道。

高富集度,特异性增强

靶富集:来自200000个MCF-7细胞的NRNP 70/RNA复合物与IgG对照。 RNA纯化后用Qubit荧光定量。与其他RIP试剂盒供应商相比,非特异性背景更好或等同(基于竞争对手方案)。

 

EpiNext CUT&LUNCH RIP 试剂盒优势对比

 CUT&LUNCH RIP 试剂盒
EpigenTek
RIP 试剂盒
供应商 A
RIP 试剂盒
供应商 M
工作流程便利性方便
总共
只需 20 个步骤 无需交联或超声处理
不太方便
>总共
50 个步骤需要固定和超声处理(需要最终用户优化)
不太方便
总共 40 个步骤。
无交联或超声处理。
所需细胞数量50,000 - 1,000,00015,000,00020,000,000
丰富的靶标范围细胞质和核 RNA-蛋白质复合物核 RNA-蛋白质复合物细胞质和核 RNA-蛋白质复合物
序列分辨率
Unique 裂解酶混合物可在两端裂解 RNA,非常接近靶蛋白相互作用 网站
基于下部
超声处理的剪切可产生不同长度的片段

RNA 未剪切
正/负控制比>200>120>200
检测时间长度1 小时 50 分钟1 - 2 天8 小时 - 2 天
富集 RNA 的下游应用qRT-PCR、RIP 芯片、RIP-SeqqRT-PCR 检测qRT-PCR、RIP 芯片、RIP-Seq
每次检测反应的价格非常高