EpigenTek的染色质（ChIP）研究，拓展您对染色质的理解

我们提供最全面的染色质研究产品，涵盖实验流程的每一步，从上游到下游。借助EpigenTek的染色质研究产品系列，拓展您对染色质的理解：

什么是染色质免疫沉淀（ChIP）？

染色质免疫沉淀（ChIP）是研究染色质相关修饰最常用的方法之一。它是一种通过特定蛋白质与基因组DNA区域结合的过程。这种流行的ChIP实验为表观遗传学研究人员提供了关于某些蛋白质或蛋白质修饰与特定DNA序列相互作用的宝贵信息。

蛋白质与DNA的相互作用对细胞功能至关重要，例如DNA复制和重组、基因转录、染色体分离、信号转导以及表观遗传沉默。了解蛋白质与DNA的相互作用可用于比较两个不同群体（如疾病组织和健康组织）中与特定基因启动子区域相关的组蛋白甲基化水平。染色质免疫沉淀方法还可以用于绘制其他各种组蛋白修饰的基因组定位。

染色质研究步骤细节

1. 分离提取染色质

染色质是由DNA和蛋白质组成的复合体，它将DNA压缩到更小的体积中以便容纳在细胞内，帮助防止DNA损伤，并控制基因表达和DNA复制。正确分离染色质样本是研究蛋白质-DNA相互作用实验中的一个重要因素。EpiGentek的专利染色质分离试剂盒采用多种方法，确保从哺乳动物或植物细胞和组织中提取完整染色质的高质量分离。

2. 染色质可及性分析

染色质结构是基因调控的重要决定因素之一，而其中的关键因素是染色质对转录因子和其他DNA结合蛋白的可及性。一般来说，染色质越紧密，转录因子和其他DNA结合蛋白就越难以接近DNA并执行其功能。相反，DNA的可及性越高，周围基因被积极转录的可能性就越大。研究染色质结构的可及性具有特别重要的意义，因为它可以提供有关核小体存在与否的信息，而核小体的存在与否会直接影响或间接影响一系列其他细胞和代谢过程。

3. 染色质免疫沉淀（ChIP）

由于蛋白质与DNA的相互作用在细胞功能中起着至关重要的作用，识别DNA结合蛋白的遗传靶点并了解蛋白质-DNA相互作用的机制对于理解细胞过程至关重要。染色质免疫沉淀（ChIP）是研究人员用于研究这些相互作用的工具之一。ChIP相较于其他方法的优势在于，它能够在活细胞中检测特定蛋白质与基因特定序列的结合。EpiGentek提供了一系列实验试剂盒解决方案，帮助您的实验室高效、准确且可重复地开展基于ChIP的实验。

4.PCR/测序（ChIP-Seq）NGS分析

进一步推动这一过程，下一代测序（NGS）技术提高了数据产出量，并降低了ChIP测序的成本。ChIP-Seq将已经讨论过的染色质免疫沉淀过程与下一代测序方法相结合，提供了一种有效的方法，用于识别转录因子和其他蛋白质的全基因组DNA结合位点。ChIP-Seq的优势在于能够在全基因组水平上解析目标蛋白结合位点的特定遗传序列。实时定量PCR（RT-qPCR）则通过使用特异性引物进行选择性扩增，分析修饰组蛋白和/或其他DNA结合蛋白在精确位点的结合位点，提供了一种替代方法。EpiGentek提供了多种经济实惠的PCR和NGS解决方案，包括完整的试剂盒套餐，方便从低量或难以处理的样本中构建高质量的DNA文库。

5.CUT&RUN-Fast/CUT&TAG原位

染色质免疫沉淀（ChIP）是一种用于研究细胞中全基因组范围内蛋白质/DNA相互作用的常用工具，通过富集目标组蛋白或转录因子复合的DNA，并通过下一代测序技术绘制相互作用区域。由于ChIP存在以下局限性：1）需要大量的起始材料；2）处理时间长；3）分辨率低，靶向切割与核酸酶释放技术（CUT&RUN）应运而生，以解决这些问题。该技术在未经固定的完整细胞或细胞核中原位进行，通过pAG-MNase融合蛋白在特定抗体占据位点处切割染色质，并释放蛋白质/DNA复合物。与ChIP相比，CUT&RUN具有诸多优势，包括需要的起始材料少、分辨率更高。该技术采用了一种新颖且独特的核酸酶混合物，具有低序列偏好性，能够同时对染色质进行片段化，并在目标蛋白/DNA复合物的两端切割/移除任何DNA序列，而不影响目标蛋白占据的DNA，从而提高了特异性和分辨率。

6. CUT&LUNCH

EpigenTek进一步改进了CUT&RUN方法，推出了新的CUT&LUNCH（靶向切割与均匀释放独特核酸复合物）技术，该技术具有极快的实验流程、进一步增强的特异性以及最小化的背景信号。

CUT&LUNCH实验的简化流程能够让您快速选择性富集目标蛋白/DNA复合物。快速的三步实验流程可在不到2小时内完成，最大限度减少细胞核损伤和染色质丢失，同时保留天然染色质结构：

第一步：抗体与目标结合（30分钟）

第二步：酶切割（10分钟）

第三步：选择性回收与纯化（60分钟）